Se inactivaron bacterias Escherichia coli y coliformes totales presentes en efluentes municipales tratados biológicamente mediante fotólisis (radiación UV-C), así como por fotocatálisis heterogénea (UV-C/TiO₂/SiO₂), utilizando 50 L de muestra del efluente, recirculados en un caudal de 1000 L/h en un fotorreactor UV, durante 150 min de reacción y temperatura constante. En cada experimento se tomaron muestras a diferentes tiempos y se contaron las unidades formadoras de colonias, determinando la cinética de inactivación de las bacterias mediante la aplicación de un diseño factorial 2x2 con covariable y mediciones repetidas. Las constantes de velocidad de inactivación de bacterias coliformes obtenidas por ambos procesos, fotólisis y fotocatálisis, indican la eficiencia en tiempos cortos de la inactivación total de E. coli y de coliformes totales. El análisis de varianza muestra significancia (p < 0.05) para el efecto del Proceso Avanzado de Oxidación, las bacterias y la covariable (unidades formadoras de colonias iniciales). La comparación de las constantes de velocidad de inactivación de bacterias en tiempos cortos de tratamiento, obtenida por la prueba t-Student, demostró que la fotólisis y la fotocatálisis heterogénea presentan diferencias significativas (p < 0.05), permitiendo a ambas cumplir con la normatividad Española, referida para E. coli.